Publications
Hugo Horlings
2024
-
Does “One Size Fits All”? Rethinking FIGO Depth of Invasion Measurements in Vulvar CancerInternational Journal of Gynecological PathologyM. C. Bleeker, T. Bosse, K. K. Van De Vijver, J. Bart, H. Horlings, T. G. Jonges, N. C. Visser, L. F. Kooreman, J. Bulten, P. C. Ewing-Graham, 2024
-
Abstract 4951: Integrative multi-omic machine learning model predicts neoadjuvant immunotherapy response using molecular data and deep learning-derived features from digital pathologyCancer ResearchL. V. Leek, V. Botha, V. A. Baxi, J. Teuwen, H. M. Horlings, S. D. Chasalow, J. V. D. Haar, L. F. Wessels, A. Debroy, E. E. Voest, 2024, 84;(6_Supplement):4951-4951
-
Image‐based multiplex immune profiling of cancer tissues: translational implications. A report of the International Immuno‐oncology Biomarker Working Group on Breast CancerThe Journal of PathologyC. A. Jahangir, D. B. Page, G. Broeckx, C. A. Gonzalez, C. Burke, C. Murphy, J. S. Reis‐Filho, A. Ly, P. W. Harms, R. R. Gupta, M. Vieth, A. I. Hida, M. Kahila, Z. Kos, P. J. Van Diest, S. Verbandt, J. Thagaard, R. Khiroya, K. Abduljabbar, G. Acosta Haab, B. Acs, S. Adams, J. S. Almeida, I. Alvarado‐Cabrero, F. Azmoudeh‐Ardalan, S. Badve, N. B. Baharun, E. R. Bellolio, V. Bheemaraju, K. R. Blenman, L. Botinelly Mendonça Fujimoto, O. Burgues, A. Chardas, M. C. U. Cheang, F. Ciompi, L. A. Cooper, A. Coosemans, G. Corredor, F. L. Dantas Portela, F. Deman, S. Demaria, S. N. Dudgeon, M. Elghazawy, C. Fernandez‐Martín, S. Fineberg, S. B. Fox, J. M. Giltnane, S. Gnjatic, P. I. Gonzalez‐Ericsson, A. Grigoriadis, N. Halama, M. G. Hanna, A. Harbhajanka, S. N. Hart, J. Hartman, S. Hewitt, H. M. Horlings, Z. Husain, S. Irshad, E. A. Janssen, T. R. Kataoka, K. Kawaguchi, A. I. Khramtsov, U. Kiraz, P. Kirtani, L. L. Kodach, K. Korski, G. Akturk, E. Scott, A. Kovács, A. Lænkholm, C. Lang‐Schwarz, D. Larsimont, J. K. Lennerz, M. Lerousseau, X. Li, A. Madabhushi, S. K. Maley, V. Manur Narasimhamurthy, D. K. Marks, E. S. Mcdonald, R. Mehrotra, S. Michiels, D. Kharidehal, F. U. A. A. Minhas, S. Mittal, D. A. Moore, S. Mushtaq, H. Nighat, T. Papathomas, F. Penault‐Llorca, R. D. Perera, C. J. Pinard, J. C. Pinto‐Cardenas, G. Pruneri, L. Pusztai, N. M. Rajpoot, B. L. Rapoport, T. T. Rau, J. M. Ribeiro, D. Rimm, A. Vincent‐Salomon, J. Saltz, S. Sayed, E. Hytopoulos, S. Mahon, K. P. Siziopikou, C. Sotiriou, A. Stenzinger, M. A. Sughayer, D. Sur, F. Symmans, S. Tanaka, T. Taxter, S. Tejpar, J. Teuwen, E. A. Thompson, T. Tramm, W. T. Tran, J. Van Der Laak, G. E. Verghese, G. Viale, N. Wahab, T. Walter, Y. Waumans, H. Y. Wen, W. Yang, Y. Yuan, J. Bartlett, S. Loibl, C. Denkert, P. Savas, S. Loi, E. Specht Stovgaard, R. Salgado, W. M. Gallagher, A. Rahman, 2024
2023
-
PatchSorter: A High Throughput Deep Learning Digital Pathology Tool for Object LabelingC. Walker, T. Talawalla, R. Toth, A. Ambekar, K. Rea, O. Chamian, F. Fan, S. Berezowska, S. Rottenberg, A. Madabhushi, M. Maillard, L. Barisoni, H. M. Horlings, A. Janowczyk, 2023
-
The prognostic value of tumor-stroma ratio and a newly developed computer-aided quantitative analysis of routine H&E slides in high-grade serous ovarian cancerL. V. Wagensveld, C. Walker, K. Hahn, J. Sanders, R. Kruitwagen, M. V. D. Aa, G. Sonke, S. Rottenberg, K. V. De Vijver, A. Janowczyk, H. Horlings, 2023
-
Abstract P3-06-01: Unleashing NK- and CD8 T cells by combining monalizumab (anti-NKG2A) and trastuzumab for metastatic HER2+ breast cancer: first results MIMOSA trialCancer ResearchV. Geurts, L. Voorwerk, K. Sikorska, R. Salgado, K. Van De Vijver, M. Van Dongen, I. Kemper, I. A. Mandjes, M. Heuver-Mes, J. Haanen, G. S. Sonke, H. Horlings, M. Kok, 2023, 83;(5_Supplement):P3-06-01-P3-06-01
-
RadioLOGIC, a healthcare model for processing electronic health records and decision-making in breast diseaseCell Reports MedicineT. Zhang, T. Tan, X. Wang, Y. Gao, L. Han, L. Balkenende, A. D’Angelo, L. Bao, H. M. Horlings, J. Teuwen, R. G. Beets-Tan, R. M. Mann, 2023
-
PROACTING: predicting pathological complete response to neoadjuvant chemotherapy in breast cancer from routine diagnostic histopathology biopsies with deep learningBreast Cancer ResearchW. Aswolinskiy, E. Munari, H. M. Horlings, L. Mulder, G. Bogina, J. Sanders, Y. Liu, A. W. Van Den Belt-Dusebout, L. Tessier, M. Balkenhol, M. Stegeman, J. Hoven, J. Wesseling, J. Van Der Laak, E. H. Lips, F. Ciompi, 2023, 25;(1)
-
CMTM6 shapes antitumor T cell response through modulating protein expression of CD58 and PD-L1Cancer CellB. Miao, Z. Hu, R. Mezzadra, L. Hoeijmakers, A. Fauster, S. Du, Z. Yang, M. Sator-Schmitt, H. Engel, X. Li, C. Broderick, G. Jin, R. Gomez-Eerland, L. Rozeman, X. Lei, H. Matsuo, C. Yang, I. Hofland, D. Peters, A. Broeks, E. Laport, A. Fitz, X. Zhao, M. A. Mahmoud, X. Ma, S. Sander, H. Liu, G. Cui, Y. Gan, W. Wu, Y. Xiao, A. J. Heck, W. Guan, S. W. Lowe, H. M. Horlings, C. Wang, T. R. Brummelkamp, C. U. Blank, T. N. Schumacher, C. Sun, 2023, 41;(10):1817-1828.e9
-
B-cells and regulatory T-cells in the microenvironment of HER2+ breast cancer are associated with decreased survival: a real-world analysis of women with HER2+ metastatic breast cancerBreast Cancer ResearchT. G. Steenbruggen, D. M. Wolf, M. J. Campbell, J. Sanders, S. Cornelissen, B. Thijssen, R. A. Salgado, C. Yau, N. O-Grady, A. Basu, R. Bhaskaran, L. Mittempergher, G. L. Hirst, J. Coppe, M. Kok, G. S. Sonke, L. J. Van ‘T Veer, H. M. Horlings, 2023, 25;(1)
-
Characterization of the Tumor Microenvironment of De Novo Oligometastatic Breast Cancer in a Nationwide CohortJCO Precision OncologyT. G. Steenbruggen, D. M. Wolf, B. Thijssen, J. Sanders, S. Cornelissen, R. Salgado, L. Mittempergher, R. Bhaskaran, A. Broeks, E. H. Lips, S. Siesling, G. S. Sonke, H. M. Horlings, L. J. Van ’T Veer, 2023
-
Immune landscape of breast tumors with low and intermediate estrogen receptor expressionnpj Breast CancerL. Voorwerk, J. Sanders, M. S. Keusters, S. Balduzzi, S. Cornelissen, M. Duijst, E. H. Lips, G. S. Sonke, S. C. Linn, H. M. Horlings, M. Kok, 2023, 9;(1)
-
PD-L1 blockade in combination with carboplatin as immune induction in metastatic lobular breast cancer: the GELATO trialNature CancerL. Voorwerk, O. I. Isaeva, H. M. Horlings, S. Balduzzi, M. Chelushkin, N. A. M. Bakker, E. Champanhet, H. Garner, K. Sikorska, C. E. Loo, I. Kemper, I. A. M. Mandjes, M. De Maaker, J. J. L. Van Geel, J. Boers, M. De Boer, R. Salgado, M. G. J. Van Dongen, G. S. Sonke, K. E. De Visser, T. N. Schumacher, C. U. Blank, L. F. A. Wessels, A. Jager, V. C. G. Tjan-Heijnen, C. P. Schröder, S. C. Linn, M. Kok, 2023, 4;(4):535-549
-
Predicting breast cancer types on and beyond molecular level in a multi-modal fashionnpj Breast CancerT. Zhang, T. Tan, L. Han, L. Appelman, J. Veltman, R. Wessels, K. M. Duvivier, C. Loo, Y. Gao, X. Wang, H. M. Horlings, R. G. H. Beets-Tan, R. M. Mann, 2023, 9;(1)
-
Spatial analyses of immune cell infiltration in cancer: current methods and future directions. A report of the International Immuno‐Oncology Biomarker Working Group on Breast CancerThe Journal of PathologyD. B. Page, G. Broeckx, C. A. Jahangir, S. Verbandt, R. R. Gupta, J. Thagaard, R. Khiroya, Z. Kos, K. Abduljabbar, G. Acosta Haab, B. Acs, J. S. Almeida, I. Alvarado‐Cabrero, F. Azmoudeh‐Ardalan, S. Badve, N. B. Baharun, E. R. Bellolio, V. Bheemaraju, K. R. Blenman, L. Botinelly Mendonça Fujimoto, O. Burgues, M. C. U. Cheang, F. Ciompi, L. A. Cooper, A. Coosemans, G. Corredor, F. L. Dantas Portela, F. Deman, S. Demaria, S. N. Dudgeon, M. Elghazawy, S. Ely, C. Fernandez‐Martín, S. Fineberg, S. B. Fox, W. M. Gallagher, J. M. Giltnane, S. Gnjatic, P. I. Gonzalez‐Ericsson, A. Grigoriadis, N. Halama, M. G. Hanna, A. Harbhajanka, A. Hardas, S. N. Hart, J. Hartman, S. Hewitt, A. I. Hida, H. M. Horlings, Z. Husain, E. Hytopoulos, S. Irshad, E. A. Janssen, M. Kahila, T. R. Kataoka, K. Kawaguchi, D. Kharidehal, A. I. Khramtsov, U. Kiraz, P. Kirtani, L. L. Kodach, K. Korski, A. Kovács, A. Laenkholm, C. Lang‐Schwarz, D. Larsimont, J. K. Lennerz, M. Lerousseau, X. Li, A. Ly, A. Madabhushi, S. K. Maley, V. Manur Narasimhamurthy, D. K. Marks, E. S. Mcdonald, R. Mehrotra, S. Michiels, F. U. A. A. Minhas, S. Mittal, D. A. Moore, S. Mushtaq, H. Nighat, T. Papathomas, F. Penault‐Llorca, R. D. Perera, C. J. Pinard, J. C. Pinto‐Cardenas, G. Pruneri, L. Pusztai, A. Rahman, N. M. Rajpoot, B. L. Rapoport, T. T. Rau, J. S. Reis‐Filho, J. M. Ribeiro, D. Rimm, A. Salomon, M. Salto‐Tellez, J. Saltz, S. Sayed, K. P. Siziopikou, C. Sotiriou, A. Stenzinger, M. A. Sughayer, D. Sur, F. Symmans, S. Tanaka, T. Taxter, S. Tejpar, J. Teuwen, E. A. Thompson, T. Tramm, W. T. Tran, J. Van Der Laak, P. J. Van Diest, G. E. Verghese, G. Viale, M. Vieth, N. Wahab, T. Walter, Y. Waumans, H. Y. Wen, W. Yang, Y. Yuan, S. Adams, J. M. S. Bartlett, S. Loibl, C. Denkert, P. Savas, S. Loi, R. Salgado, E. Specht Stovgaard, G. Akturk, N. Bouchmaa, 2023
-
Pitfalls in machine learning‐based assessment of tumor‐infiltrating lymphocytes in breast cancer: A report of the International Immuno‐Oncology Biomarker Working Group on Breast CancerThe Journal of PathologyJ. Thagaard, G. Broeckx, D. B. Page, C. A. Jahangir, S. Verbandt, Z. Kos, R. Gupta, R. Khiroya, K. Abduljabbar, G. Acosta Haab, B. Acs, G. Akturk, J. S. Almeida, I. Alvarado‐Cabrero, M. Amgad, F. Azmoudeh‐Ardalan, S. Badve, N. B. Baharun, E. Balslev, E. R. Bellolio, V. Bheemaraju, K. R. Blenman, L. Botinelly Mendonça Fujimoto, N. Bouchmaa, O. Burgues, A. Chardas, M. Chon U Cheang, F. Ciompi, L. A. Cooper, A. Coosemans, G. Corredor, A. B. Dahl, F. L. Dantas Portela, F. Deman, S. Demaria, J. Doré Hansen, S. N. Dudgeon, T. Ebstrup, M. Elghazawy, C. Fernandez‐Martín, S. B. Fox, W. M. Gallagher, J. M. Giltnane, S. Gnjatic, P. I. Gonzalez‐Ericsson, A. Grigoriadis, N. Halama, M. G. Hanna, A. Harbhajanka, S. N. Hart, J. Hartman, S. Hauberg, S. Hewitt, A. I. Hida, H. M. Horlings, Z. Husain, E. Hytopoulos, S. Irshad, E. A. Janssen, M. Kahila, T. R. Kataoka, K. Kawaguchi, D. Kharidehal, A. I. Khramtsov, U. Kiraz, P. Kirtani, L. L. Kodach, K. Korski, A. Kovács, A. Laenkholm, C. Lang‐Schwarz, D. Larsimont, J. K. Lennerz, M. Lerousseau, X. Li, A. Ly, A. Madabhushi, S. K. Maley, V. Manur Narasimhamurthy, D. K. Marks, E. S. Mcdonald, R. Mehrotra, S. Michiels, F. U. A. A. Minhas, S. Mittal, D. A. Moore, S. Mushtaq, H. Nighat, T. Papathomas, F. Penault‐Llorca, R. D. Perera, C. J. Pinard, J. C. Pinto‐Cardenas, G. Pruneri, L. Pusztai, A. Rahman, N. M. Rajpoot, B. L. Rapoport, T. T. Rau, J. S. Reis‐Filho, J. M. Ribeiro, D. Rimm, A. Roslind, A. Vincent‐Salomon, M. Salto‐Tellez, J. Saltz, S. Sayed, E. Scott, K. P. Siziopikou, C. Sotiriou, A. Stenzinger, M. A. Sughayer, D. Sur, S. Fineberg, F. Symmans, S. Tanaka, T. Taxter, S. Tejpar, J. Teuwen, E. A. Thompson, T. Tramm, W. T. Tran, J. Van Der Laak, P. J. Van Diest, G. E. Verghese, G. Viale, M. Vieth, N. Wahab, T. Walter, Y. Waumans, H. Y. Wen, W. Yang, Y. Yuan, R. M. Zin, S. Adams, J. Bartlett, S. Loibl, C. Denkert, P. Savas, S. Loi, R. Salgado, E. Specht Stovgaard, 2023, 260;(5):498-513
-
1240P Multi-centric validation of an AI-based sTIL% scoring model for breast cancer H&E whole-slide imagesAnnals of OncologyY. Schirris, R. Voorthuis, M. Opdam, E. Gavves, R. De Menezes, S. Linn, H. Horlings, 2023, 34
-
474P ctDNA-based copy number dynamics during anti-PD1 treatment in patients with metastatic triple-negative breast cancerAnnals of OncologyA. Lin, O. Isaeva, D. Vessies, T. Deger, L. Voorwerk, V. Geurts, H. Horlings, J. Martens, L. Wessels, D. Van Den Broek, M. Kok, 2023, 34
-
163MO Single-cell T cell dynamics induced by neoadjuvant nivolumab +/- ipilimumab in early triple negative breast cancer with tumor-infiltrating lymphocytes (BELLINI trial)Immuno-Oncology and TechnologyO. Isaeva, I. Nederlof, M. De Graaf, B. Boeckx, J. Traets, I. Mandjes, K. Van De Vijver, M. Chelushkin, C. Drukker, M. Dongen, G. Sonke, S. Linn, C. Blank, K. De Visser, R. Salgado, L. Wessels, T. Schumacher, H. Horlings, D. Lambrechts, M. Kok, 2023, 20
-
Unleashing NK- and CD8 T cells by combining monalizumab and trastuzumab for metastatic HER2-positive breast cancer: Results of the MIMOSA trialThe BreastV. Geurts, L. Voorwerk, S. Balduzzi, R. Salgado, K. Van De Vijver, M. Van Dongen, I. Kemper, I. Mandjes, M. Heuver, W. Sparreboom, J. Haanen, G. Sonke, H. Horlings, M. Kok, 2023, 70
-
BluePrint molecular subtypes predict response to neoadjuvant pertuzumab in HER2-positive breast cancerBreast Cancer ResearchM. C. Liefaard, A. Van Der Voort, M. S. Van Ramshorst, J. Sanders, S. Vonk, H. M. Horlings, S. Siesling, L. De Munck, A. E. Van Leeuwen, M. Kleijn, L. Mittempergher, M. M. Kuilman, A. M. Glas, J. Wesseling, E. H. Lips, G. S. Sonke, 2023, 25;(1)
2022
-
DeepSMILE: Contrastive self-supervised pre-training benefits MSI and HRD classification directly from H&E whole-slide images in colorectal and breast cancerMedical Image AnalysisY. Schirris, E. Gavves, I. Nederlof, H. M. Horlings, J. Teuwen, 2022, 79
-
HRD-related morphology discovery in breast cancer by controlling for confounding factorsCell Reports MedicineY. Schirris, H. M. Horlings, 2022, 3;(12):100873
-
WeakSTIL: weak whole-slide image level stromal tumor infiltrating lymphocyte scores are all you needMedical Imaging 2022: Digital and Computational PathologyY. Schirris, M. Engelaer, A. Panteli, H. M. Horlings, E. Gavves, J. Teuwen, 2022
-
Establishment of the Dutch Nationwide, Interdisciplinary Infrastructure and Biobank for Fundamental and Translational Ovarian Cancer Research: Archipelago of Ovarian Cancer ResearchGynecologic and Obstetric InvestigationH. S. Zelisse, M. D. Van Gent, S. De Ridder, M. A. Van Der Aa, A. M. Van Altena, J. Bart, J. A. Belien, I. A. Boere, S. L. Bosch, A. Broeks, J. Bulten, M. Collée, F. H. Groenendijk, H. M. Horlings, M. P. Jansen, T. G. Jonges, L. F. Kooreman, C. D. De Kroon, S. Lambrechts, C. A. Lok, J. M. Piek, A. K. Reyners, E. Roes, M. Simons, G. B. A. Wisman, R. Yigit, R. P. Zweemer, C. H. Mom, M. J. Van De Vijver, F. Dijk, 2022, 87;(6):389-397
2021
-
Sparse-shot learning with exclusive cross-entropy for extremely many localisationsProceedings of the IEEE/CVF International Conference on Computer Vision (ICCV)A. Panteli, J. Teuwen, H. Horlings, E. Gavves, 2021