Publications
Hugo Horlings
2024
-
Does “One Size Fits All”? Rethinking FIGO Depth of Invasion Measurements in Vulvar CancerInternational Journal of Gynecological PathologyM. C. Bleeker, T. Bosse, K. K. Van De Vijver, J. Bart, H. Horlings, T. G. Jonges, N. C. Visser, L. F. Kooreman, J. Bulten, P. C. Ewing-Graham, 2024
Abstract
Loading... -
Abstract 4951: Integrative multi-omic machine learning model predicts neoadjuvant immunotherapy response using molecular data and deep learning-derived features from digital pathologyCancer ResearchL. V. Leek, V. Botha, V. A. Baxi, J. Teuwen, H. M. Horlings, S. D. Chasalow, J. V. D. Haar, L. F. Wessels, A. Debroy, E. E. Voest, 2024, 84;(6_Supplement):4951-4951
Abstract
Loading... -
Tumor-Infiltrating Lymphocytes in Patients With Stage I Triple-Negative Breast Cancer Untreated With ChemotherapyJAMA OncologyV. C. M. Geurts, S. Balduzzi, T. G. Steenbruggen, S. C. Linn, S. Siesling, S. S. Badve, A. Demichele, M. Ignatiadis, R. A. Leon-Ferre, M. P. Goetz, A. C. Wolff, N. Klar, S. Michiels, S. Loi, S. Adams, H. M. Horlings, G. S. Sonke, R. Salgado, M. Kok, 2024
Abstract
Loading... -
Image‐based multiplex immune profiling of cancer tissues: translational implications. A report of the International Immuno‐oncology Biomarker Working Group on Breast CancerThe Journal of PathologyC. A. Jahangir, D. B. Page, G. Broeckx, C. A. Gonzalez, C. Burke, C. Murphy, J. S. Reis‐Filho, A. Ly, P. W. Harms, R. R. Gupta, M. Vieth, A. I. Hida, M. Kahila, Z. Kos, P. J. Van Diest, S. Verbandt, J. Thagaard, R. Khiroya, K. Abduljabbar, G. Acosta Haab, B. Acs, S. Adams, J. S. Almeida, I. Alvarado‐Cabrero, F. Azmoudeh‐Ardalan, S. Badve, N. B. Baharun, E. R. Bellolio, V. Bheemaraju, K. R. Blenman, L. Botinelly Mendonça Fujimoto, O. Burgues, A. Chardas, M. C. U. Cheang, F. Ciompi, L. A. Cooper, A. Coosemans, G. Corredor, F. L. Dantas Portela, F. Deman, S. Demaria, S. N. Dudgeon, M. Elghazawy, C. Fernandez‐Martín, S. Fineberg, S. B. Fox, J. M. Giltnane, S. Gnjatic, P. I. Gonzalez‐Ericsson, A. Grigoriadis, N. Halama, M. G. Hanna, A. Harbhajanka, S. N. Hart, J. Hartman, S. Hewitt, H. M. Horlings, Z. Husain, S. Irshad, E. A. Janssen, T. R. Kataoka, K. Kawaguchi, A. I. Khramtsov, U. Kiraz, P. Kirtani, L. L. Kodach, K. Korski, G. Akturk, E. Scott, A. Kovács, A. Lænkholm, C. Lang‐Schwarz, D. Larsimont, J. K. Lennerz, M. Lerousseau, X. Li, A. Madabhushi, S. K. Maley, V. Manur Narasimhamurthy, D. K. Marks, E. S. Mcdonald, R. Mehrotra, S. Michiels, D. Kharidehal, F. U. A. A. Minhas, S. Mittal, D. A. Moore, S. Mushtaq, H. Nighat, T. Papathomas, F. Penault‐Llorca, R. D. Perera, C. J. Pinard, J. C. Pinto‐Cardenas, G. Pruneri, L. Pusztai, N. M. Rajpoot, B. L. Rapoport, T. T. Rau, J. M. Ribeiro, D. Rimm, A. Vincent‐Salomon, J. Saltz, S. Sayed, E. Hytopoulos, S. Mahon, K. P. Siziopikou, C. Sotiriou, A. Stenzinger, M. A. Sughayer, D. Sur, F. Symmans, S. Tanaka, T. Taxter, S. Tejpar, J. Teuwen, E. A. Thompson, T. Tramm, W. T. Tran, J. Van Der Laak, G. E. Verghese, G. Viale, N. Wahab, T. Walter, Y. Waumans, H. Y. Wen, W. Yang, Y. Yuan, J. Bartlett, S. Loibl, C. Denkert, P. Savas, S. Loi, E. Specht Stovgaard, R. Salgado, W. M. Gallagher, A. Rahman, 2024
Abstract
Loading...
2023
-
PatchSorter: A High Throughput Deep Learning Digital Pathology Tool for Object LabelingC. Walker, T. Talawalla, R. Toth, A. Ambekar, K. Rea, O. Chamian, F. Fan, S. Berezowska, S. Rottenberg, A. Madabhushi, M. Maillard, L. Barisoni, H. M. Horlings, A. Janowczyk, 2023
Abstract
Loading... -
The prognostic value of tumor-stroma ratio and a newly developed computer-aided quantitative analysis of routine H&E slides in high-grade serous ovarian cancerL. V. Wagensveld, C. Walker, K. Hahn, J. Sanders, R. Kruitwagen, M. V. D. Aa, G. Sonke, S. Rottenberg, K. V. De Vijver, A. Janowczyk, H. Horlings, 2023
Abstract
Loading... -
Abstract P3-06-01: Unleashing NK- and CD8 T cells by combining monalizumab (anti-NKG2A) and trastuzumab for metastatic HER2+ breast cancer: first results MIMOSA trialCancer ResearchV. Geurts, L. Voorwerk, K. Sikorska, R. Salgado, K. Van De Vijver, M. Van Dongen, I. Kemper, I. A. Mandjes, M. Heuver-Mes, J. Haanen, G. S. Sonke, H. Horlings, M. Kok, 2023, 83;(5_Supplement):P3-06-01-P3-06-01
Abstract
Loading... -
PROACTING: predicting pathological complete response to neoadjuvant chemotherapy in breast cancer from routine diagnostic histopathology biopsies with deep learningBreast Cancer ResearchW. Aswolinskiy, E. Munari, H. M. Horlings, L. Mulder, G. Bogina, J. Sanders, Y. Liu, A. W. Van Den Belt-Dusebout, L. Tessier, M. Balkenhol, M. Stegeman, J. Hoven, J. Wesseling, J. Van Der Laak, E. H. Lips, F. Ciompi, 2023, 25;(1)
Abstract
Loading... -
CMTM6 shapes antitumor T cell response through modulating protein expression of CD58 and PD-L1Cancer CellB. Miao, Z. Hu, R. Mezzadra, L. Hoeijmakers, A. Fauster, S. Du, Z. Yang, M. Sator-Schmitt, H. Engel, X. Li, C. Broderick, G. Jin, R. Gomez-Eerland, L. Rozeman, X. Lei, H. Matsuo, C. Yang, I. Hofland, D. Peters, A. Broeks, E. Laport, A. Fitz, X. Zhao, M. A. Mahmoud, X. Ma, S. Sander, H. Liu, G. Cui, Y. Gan, W. Wu, Y. Xiao, A. J. Heck, W. Guan, S. W. Lowe, H. M. Horlings, C. Wang, T. R. Brummelkamp, C. U. Blank, T. N. Schumacher, C. Sun, 2023, 41;(10):1817-1828.e9
Abstract
Loading... -
B-cells and regulatory T-cells in the microenvironment of HER2+ breast cancer are associated with decreased survival: a real-world analysis of women with HER2+ metastatic breast cancerBreast Cancer ResearchT. G. Steenbruggen, D. M. Wolf, M. J. Campbell, J. Sanders, S. Cornelissen, B. Thijssen, R. A. Salgado, C. Yau, N. O-Grady, A. Basu, R. Bhaskaran, L. Mittempergher, G. L. Hirst, J. Coppe, M. Kok, G. S. Sonke, L. J. Van ‘T Veer, H. M. Horlings, 2023, 25;(1)
Abstract
Loading... -
Characterization of the Tumor Microenvironment of De Novo Oligometastatic Breast Cancer in a Nationwide CohortJCO Precision OncologyT. G. Steenbruggen, D. M. Wolf, B. Thijssen, J. Sanders, S. Cornelissen, R. Salgado, L. Mittempergher, R. Bhaskaran, A. Broeks, E. H. Lips, S. Siesling, G. S. Sonke, H. M. Horlings, L. J. Van ’T Veer, 2023
Abstract
Loading... -
Immune landscape of breast tumors with low and intermediate estrogen receptor expressionnpj Breast CancerL. Voorwerk, J. Sanders, M. S. Keusters, S. Balduzzi, S. Cornelissen, M. Duijst, E. H. Lips, G. S. Sonke, S. C. Linn, H. M. Horlings, M. Kok, 2023, 9;(1)
Abstract
Loading... -
PD-L1 blockade in combination with carboplatin as immune induction in metastatic lobular breast cancer: the GELATO trialNature CancerL. Voorwerk, O. I. Isaeva, H. M. Horlings, S. Balduzzi, M. Chelushkin, N. A. M. Bakker, E. Champanhet, H. Garner, K. Sikorska, C. E. Loo, I. Kemper, I. A. M. Mandjes, M. De Maaker, J. J. L. Van Geel, J. Boers, M. De Boer, R. Salgado, M. G. J. Van Dongen, G. S. Sonke, K. E. De Visser, T. N. Schumacher, C. U. Blank, L. F. A. Wessels, A. Jager, V. C. G. Tjan-Heijnen, C. P. Schröder, S. C. Linn, M. Kok, 2023, 4;(4):535-549
Abstract
Loading... -
Predicting breast cancer types on and beyond molecular level in a multi-modal fashionnpj Breast CancerT. Zhang, T. Tan, L. Han, L. Appelman, J. Veltman, R. Wessels, K. M. Duvivier, C. Loo, Y. Gao, X. Wang, H. M. Horlings, R. G. H. Beets-Tan, R. M. Mann, 2023, 9;(1)
Abstract
Loading... -
Spatial analyses of immune cell infiltration in cancer: current methods and future directions. A report of the International Immuno‐Oncology Biomarker Working Group on Breast CancerThe Journal of PathologyD. B. Page, G. Broeckx, C. A. Jahangir, S. Verbandt, R. R. Gupta, J. Thagaard, R. Khiroya, Z. Kos, K. Abduljabbar, G. Acosta Haab, B. Acs, J. S. Almeida, I. Alvarado‐Cabrero, F. Azmoudeh‐Ardalan, S. Badve, N. B. Baharun, E. R. Bellolio, V. Bheemaraju, K. R. Blenman, L. Botinelly Mendonça Fujimoto, O. Burgues, M. C. U. Cheang, F. Ciompi, L. A. Cooper, A. Coosemans, G. Corredor, F. L. Dantas Portela, F. Deman, S. Demaria, S. N. Dudgeon, M. Elghazawy, S. Ely, C. Fernandez‐Martín, S. Fineberg, S. B. Fox, W. M. Gallagher, J. M. Giltnane, S. Gnjatic, P. I. Gonzalez‐Ericsson, A. Grigoriadis, N. Halama, M. G. Hanna, A. Harbhajanka, A. Hardas, S. N. Hart, J. Hartman, S. Hewitt, A. I. Hida, H. M. Horlings, Z. Husain, E. Hytopoulos, S. Irshad, E. A. Janssen, M. Kahila, T. R. Kataoka, K. Kawaguchi, D. Kharidehal, A. I. Khramtsov, U. Kiraz, P. Kirtani, L. L. Kodach, K. Korski, A. Kovács, A. Laenkholm, C. Lang‐Schwarz, D. Larsimont, J. K. Lennerz, M. Lerousseau, X. Li, A. Ly, A. Madabhushi, S. K. Maley, V. Manur Narasimhamurthy, D. K. Marks, E. S. Mcdonald, R. Mehrotra, S. Michiels, F. U. A. A. Minhas, S. Mittal, D. A. Moore, S. Mushtaq, H. Nighat, T. Papathomas, F. Penault‐Llorca, R. D. Perera, C. J. Pinard, J. C. Pinto‐Cardenas, G. Pruneri, L. Pusztai, A. Rahman, N. M. Rajpoot, B. L. Rapoport, T. T. Rau, J. S. Reis‐Filho, J. M. Ribeiro, D. Rimm, A. Salomon, M. Salto‐Tellez, J. Saltz, S. Sayed, K. P. Siziopikou, C. Sotiriou, A. Stenzinger, M. A. Sughayer, D. Sur, F. Symmans, S. Tanaka, T. Taxter, S. Tejpar, J. Teuwen, E. A. Thompson, T. Tramm, W. T. Tran, J. Van Der Laak, P. J. Van Diest, G. E. Verghese, G. Viale, M. Vieth, N. Wahab, T. Walter, Y. Waumans, H. Y. Wen, W. Yang, Y. Yuan, S. Adams, J. M. S. Bartlett, S. Loibl, C. Denkert, P. Savas, S. Loi, R. Salgado, E. Specht Stovgaard, G. Akturk, N. Bouchmaa, 2023
Abstract
Loading... -
Pitfalls in machine learning‐based assessment of tumor‐infiltrating lymphocytes in breast cancer: A report of the International Immuno‐Oncology Biomarker Working Group on Breast CancerThe Journal of PathologyJ. Thagaard, G. Broeckx, D. B. Page, C. A. Jahangir, S. Verbandt, Z. Kos, R. Gupta, R. Khiroya, K. Abduljabbar, G. Acosta Haab, B. Acs, G. Akturk, J. S. Almeida, I. Alvarado‐Cabrero, M. Amgad, F. Azmoudeh‐Ardalan, S. Badve, N. B. Baharun, E. Balslev, E. R. Bellolio, V. Bheemaraju, K. R. Blenman, L. Botinelly Mendonça Fujimoto, N. Bouchmaa, O. Burgues, A. Chardas, M. Chon U Cheang, F. Ciompi, L. A. Cooper, A. Coosemans, G. Corredor, A. B. Dahl, F. L. Dantas Portela, F. Deman, S. Demaria, J. Doré Hansen, S. N. Dudgeon, T. Ebstrup, M. Elghazawy, C. Fernandez‐Martín, S. B. Fox, W. M. Gallagher, J. M. Giltnane, S. Gnjatic, P. I. Gonzalez‐Ericsson, A. Grigoriadis, N. Halama, M. G. Hanna, A. Harbhajanka, S. N. Hart, J. Hartman, S. Hauberg, S. Hewitt, A. I. Hida, H. M. Horlings, Z. Husain, E. Hytopoulos, S. Irshad, E. A. Janssen, M. Kahila, T. R. Kataoka, K. Kawaguchi, D. Kharidehal, A. I. Khramtsov, U. Kiraz, P. Kirtani, L. L. Kodach, K. Korski, A. Kovács, A. Laenkholm, C. Lang‐Schwarz, D. Larsimont, J. K. Lennerz, M. Lerousseau, X. Li, A. Ly, A. Madabhushi, S. K. Maley, V. Manur Narasimhamurthy, D. K. Marks, E. S. Mcdonald, R. Mehrotra, S. Michiels, F. U. A. A. Minhas, S. Mittal, D. A. Moore, S. Mushtaq, H. Nighat, T. Papathomas, F. Penault‐Llorca, R. D. Perera, C. J. Pinard, J. C. Pinto‐Cardenas, G. Pruneri, L. Pusztai, A. Rahman, N. M. Rajpoot, B. L. Rapoport, T. T. Rau, J. S. Reis‐Filho, J. M. Ribeiro, D. Rimm, A. Roslind, A. Vincent‐Salomon, M. Salto‐Tellez, J. Saltz, S. Sayed, E. Scott, K. P. Siziopikou, C. Sotiriou, A. Stenzinger, M. A. Sughayer, D. Sur, S. Fineberg, F. Symmans, S. Tanaka, T. Taxter, S. Tejpar, J. Teuwen, E. A. Thompson, T. Tramm, W. T. Tran, J. Van Der Laak, P. J. Van Diest, G. E. Verghese, G. Viale, M. Vieth, N. Wahab, T. Walter, Y. Waumans, H. Y. Wen, W. Yang, Y. Yuan, R. M. Zin, S. Adams, J. Bartlett, S. Loibl, C. Denkert, P. Savas, S. Loi, R. Salgado, E. Specht Stovgaard, 2023, 260;(5):498-513
Abstract
Loading... -
1240P Multi-centric validation of an AI-based sTIL% scoring model for breast cancer H&E whole-slide imagesAnnals of OncologyY. Schirris, R. Voorthuis, M. Opdam, E. Gavves, R. De Menezes, S. Linn, H. Horlings, 2023, 34
Abstract
Loading... -
474P ctDNA-based copy number dynamics during anti-PD1 treatment in patients with metastatic triple-negative breast cancerAnnals of OncologyA. Lin, O. Isaeva, D. Vessies, T. Deger, L. Voorwerk, V. Geurts, H. Horlings, J. Martens, L. Wessels, D. Van Den Broek, M. Kok, 2023, 34
Abstract
Loading... -
163MO Single-cell T cell dynamics induced by neoadjuvant nivolumab +/- ipilimumab in early triple negative breast cancer with tumor-infiltrating lymphocytes (BELLINI trial)Immuno-Oncology and TechnologyO. Isaeva, I. Nederlof, M. De Graaf, B. Boeckx, J. Traets, I. Mandjes, K. Van De Vijver, M. Chelushkin, C. Drukker, M. Dongen, G. Sonke, S. Linn, C. Blank, K. De Visser, R. Salgado, L. Wessels, T. Schumacher, H. Horlings, D. Lambrechts, M. Kok, 2023, 20
Abstract
Loading... -
Unleashing NK- and CD8 T cells by combining monalizumab and trastuzumab for metastatic HER2-positive breast cancer: Results of the MIMOSA trialThe BreastV. Geurts, L. Voorwerk, S. Balduzzi, R. Salgado, K. Van De Vijver, M. Van Dongen, I. Kemper, I. Mandjes, M. Heuver, W. Sparreboom, J. Haanen, G. Sonke, H. Horlings, M. Kok, 2023, 70
Abstract
Loading... -
BluePrint molecular subtypes predict response to neoadjuvant pertuzumab in HER2-positive breast cancerBreast Cancer ResearchM. C. Liefaard, A. Van Der Voort, M. S. Van Ramshorst, J. Sanders, S. Vonk, H. M. Horlings, S. Siesling, L. De Munck, A. E. Van Leeuwen, M. Kleijn, L. Mittempergher, M. M. Kuilman, A. M. Glas, J. Wesseling, E. H. Lips, G. S. Sonke, 2023, 25;(1)
Abstract
Loading...
2022
-
DeepSMILE: Contrastive self-supervised pre-training benefits MSI and HRD classification directly from H&E whole-slide images in colorectal and breast cancerMedical Image AnalysisY. Schirris, E. Gavves, I. Nederlof, H. M. Horlings, J. Teuwen, 2022, 79
Abstract
Loading... -
HRD-related morphology discovery in breast cancer by controlling for confounding factorsCell Reports MedicineY. Schirris, H. M. Horlings, 2022, 3;(12):100873
Abstract
Loading... -
WeakSTIL: weak whole-slide image level stromal tumor infiltrating lymphocyte scores are all you needMedical Imaging 2022: Digital and Computational PathologyY. Schirris, M. Engelaer, A. Panteli, H. M. Horlings, E. Gavves, J. Teuwen, 2022
Abstract
Loading... -
Establishment of the Dutch Nationwide, Interdisciplinary Infrastructure and Biobank for Fundamental and Translational Ovarian Cancer Research: Archipelago of Ovarian Cancer ResearchGynecologic and Obstetric InvestigationH. S. Zelisse, M. D. Van Gent, S. De Ridder, M. A. Van Der Aa, A. M. Van Altena, J. Bart, J. A. Belien, I. A. Boere, S. L. Bosch, A. Broeks, J. Bulten, M. Collée, F. H. Groenendijk, H. M. Horlings, M. P. Jansen, T. G. Jonges, L. F. Kooreman, C. D. De Kroon, S. Lambrechts, C. A. Lok, J. M. Piek, A. K. Reyners, E. Roes, M. Simons, G. B. A. Wisman, R. Yigit, R. P. Zweemer, C. H. Mom, M. J. Van De Vijver, F. Dijk, 2022, 87;(6):389-397
Abstract
Loading...
2021
-
Sparse-shot learning with exclusive cross-entropy for extremely many localisationsProceedings of the IEEE/CVF International Conference on Computer Vision (ICCV)A. Panteli, J. Teuwen, H. Horlings, E. Gavves, 2021
Abstract
Loading...